隋朝末年，天下大亂。各路諸侯，自立為王，硝煙不斷，百姓遭殃。十三個(gè)平民百姓雖然出身不同，但都被亂世所害逼入絕境。經(jīng)歷了無(wú)數(shù)的腥風(fēng)血雨，他們懷著家仇國(guó)恨，循入空門。但是黑暗勢(shì)力依然不放過(guò)他們，死亡當(dāng)頭，他們?yōu)榍笞员＃嗑毼涔Α榱颂煜绿剑@十三個(gè)和尚救護(hù)明君李世民，滅掉了兇殘的王世充，演出了一曲英雄壯歌。  
太尉“王世充”野心勃勃企圖篡位奪權(quán)，脅幼主“楊侗”，屠殺異己。他感到天下武林人士是他極大威脅，便下達(dá)“禁武令”；其侄子“王仁則”、義子“王仁義”武功高超，充當(dāng)犬鷹。短短的一個(gè)月內(nèi)，洛陽(yáng)地區(qū)的武林門派如：神劍山莊、白猿圣手、霸王槍、龍爪派、銀鉤門等等，幾乎被掃除殆盡！最后的箭頭，指向與世無(wú)爭(zhēng)，紅塵不到的方外凈地“少林寺”。
曇宗，是少林寺的武術(shù)總教頭，武功冠絕武林，王世充為收歸己用，命王仁則送請(qǐng)?zhí)仙倭郑瑥?qiáng)邀曇宗前來(lái)，并設(shè)下“板凳陣”、“內(nèi)功”、“機(jī)關(guān)”和“蒺藜陣”重重考驗(yàn)，欲聘之為府中“首席教頭”；無(wú)奈曇宗一心向佛，淡薄名利，婉言謝絕。但王世充并不放過(guò)，他將自己八年前，謀害江都督造“張衡”一家的滅門血案，嫁禍給了曇宗；致使張衡的長(zhǎng)子“張?zhí)毂！保池?fù)可怕的暗器箱，夜闖少林寺，暗放毒蛇、三番兩次，要置曇宗于死地！他還買通賣藝人“佟銳”、“佟鈴”兄妹，設(shè)下奪命陷阱欲害曇宗……
為了充填自己的金庫(kù)，王世充又假公濟(jì)私，抄了洛陽(yáng)首富“高達(dá)”一家，殺掉高家36口人，吞沒所有產(chǎn)業(yè)，唯獨(dú)高家的浪蕩公子 “高飛揚(yáng)”僥幸逃過(guò)一死。為了報(bào)仇，高飛揚(yáng)深山學(xué)藝。面對(duì)王世充的無(wú)情追殺，慌不擇路的高飛楊闖入魏王“李密”的軍營(yíng)，結(jié)識(shí)憨厚的大塊頭“九斤”和一代裊雄程咬金。沒想到李密又投向了王世充。高飛揚(yáng)隨“程咬金”、“秦瓊”兩位名將，以及九斤四個(gè)人，委曲求全，寄身于虎穴之中，危機(jī)環(huán)伺，他們隨時(shí)可能送命……
佟銳、佟鈴兄妹在洛陽(yáng)城本以賣藝為生；怎知被性好漁色，蠻橫的王仁則看中，處心積慮霸占佟玲，幸得樸實(shí)的農(nóng)民“周錦福”相助，暫時(shí)躲過(guò)了一劫；佟玲和兄長(zhǎng)失散，無(wú)依無(wú)靠，便住進(jìn)周家，兩人耳鬢廝磨，日久生情，論及婚嫁，卻撞見了兄長(zhǎng)。佟銳反對(duì)婚事，在這時(shí)候佟鈴，再次被王仁則所擄，抵死不從，逼得她自殺身亡；王仁則的惡行，令佟銳、周錦福痛恨不已，兩人武功雖然不濟(jì)，卻滋生報(bào)仇之心……
王世充疏于政事，聽從江湖術(shù)士“桓法嗣”之言，殘害忠良，欲奪權(quán)篡位；桓法嗣表面輔佐王世充，其實(shí)想加速其滅亡……
斯時(shí)，曇宗隱隱感覺到，烽煙四起，天下已經(jīng)大亂，為了保寺濟(jì)民，創(chuàng)立了“羅漢奇門棍陣”；此陣由“八卦”、“五行”組成，必須齊聚十三人。于是，曇宗邊躲避王世充追殺，邊尋覓可造之材，歷盡艱險(xiǎn)，收錄農(nóng)民周錦福、官宦子弟張?zhí)毂！⒙淦谴笊俑唢w揚(yáng)、江湖藝人佟銳、陰沉術(shù)士桓法嗣、嗜武如狂的“姚漢武”、憨直的馬弁九斤、改邪歸正的“王仁義”，以及少林寺的“僧豐”、“僧滿”、“道廣”、“智守”和曇宗本人組成了棍陣！
張?zhí)毂Ｅc王世充的女兒王玉鳳青梅竹馬，自幼訂有婚約。王世充為博得隋煬帝之寵，殺害了張衡一家。長(zhǎng)子張?zhí)毂e幸逃脫。王世充卻別有用心的留下弟弟張?zhí)煊溃⒏钠涿麨椤巴跞柿x”！……一場(chǎng)情人訣別、兄弟爭(zhēng)斗更加殘忍。讓人刻骨銘心。
李世民為救民于水火，領(lǐng)兵討伐洛陽(yáng)城；王世充守城不出，兩軍隔河對(duì)峙！李世民為達(dá)目的，率秦瓊、程咬金微服渡河刺探軍情；不料被王仁義所擒。王仁義立下大功，野心勃勃，想先成為鄭國(guó)駙馬，再除去那王仁則，進(jìn)而登上大位；最后，收拾王世充以報(bào)家仇！可惜事跡敗露……
曇宗為了早日天下太平，便自告奮勇率領(lǐng)弟子，冒死潛入了洛陽(yáng)城營(yíng)救李世民；他們師徒十三人，沖進(jìn)固若金湯的天牢，里面機(jī)關(guān)遍布，處處要命……曇宗請(qǐng)纓率領(lǐng)弟子們，施展少林絕技，攀越城頭來(lái)到王宮勸王世充放下屠刀，立地成佛。王世充執(zhí)迷不悟，命大隊(duì)的禁軍狙殺……好一場(chǎng)惡戰(zhàn)。歷史證明。沒有十三棍僧就沒有大唐王朝。
唐軍獲得空前勝利，李世民封曇宗為“大將軍”，請(qǐng)他與十二僧隨之征討！曇宗清心寡欲，不愿為官，他情愿回少林寺，重整寺院，振興少林武學(xué)，其高超的情節(jié)，不僅受李世民欽佩，也令世人永遠(yuǎn)景仰！