這一次，Flynn Carsen的任務是探尋傳說中所羅門王寶藏的所在，并揭開自己的家族之謎。他的紅顏知己不再是可愛的Nicole Noone（Sonya Walger扮演），而是一個名叫Emily Davenport（Gabrielle Anwar扮演）的學者型女人，她的知識甚至超出了Flynn的想像！  
自去年成為"圖書館員"并成功完成第一個任務之后，為了阻止邪惡侵襲世界，Flynn Carsen又經歷了許多同樣驚險刺激的生死任務，其中之一就是到猶他州去尋找神秘的水晶頭骨。更重要的是，他離開了母親的家，擁有了屬于自己的公寓。但是他仍然處于"頂頭上司"Judson的監管之下，Judson告訴他："為了明天更美好，你必須要學會放棄一些東西。
與此同時，在Flynn的生日宴會上，父親的朋友Jerry"叔叔"向Flynn說起了父親當年追求母親的浪漫史，Flynn也記起了小時候那些蠢得沒邊的"睡前故事"，還有父親的那枚護身符。母親曾說這東西是從二手商店買來的。當Flynn回到家里，發現有人將他的屋子翻了個底朝天。他們不僅襲擊了Flynn，還將Flynn當天通過郵件收到的卷軸搶走，那上面有一個神秘的符號。
據說這個卷軸上的地圖記錄了所羅門王寶藏所在地的部分線索，Flynn當然不能讓這群小賊找到其余的線索，更不能讓他們將寶藏據為己有。Judson還告訴他，寶藏中有一本所羅門之書，翻開書的人能夠控制時間和空間，所以這個秘密絕不能讓人知曉。
Flynn啟程前往摩洛哥，去一些羅馬時代的遺跡中尋找線索。在路上，他偶遇 Emily Davenport (Anwar)，一個比Flynn還多三個學位的女考古學家，她說起古代歷史、圣經文字以及地理這些東西來簡直口若懸河。在他們尋找地圖的過程中，Flynn還發現父親那枚本該是"便宜貨"的護身符里竟然暗藏玄機！壞人不停對他們發難，但Emily仍堅決要跟隨Flynn去肯尼亞尋找其余地圖碎片。最終，Jerry"叔叔"又出現了……